Ha nem állnak fel a bizottság által is jóváhagyott kifizetési ügynökségek, és nem honosítják meg az EU-konform könyvelési rendszereket, akkor búcsút inthetnek a támogatásoknak. Szinte mindegyik tagjelölttel szemben visszatérően bírálják a megbízható és független belső pénzügyi ellenőrzés és a tárcák közötti koordináció hiányát. Elégtelenül működik vagy egyáltalán nincs felügyelő hatóság, amely figyelemmel követné a pályáztatás, tenderkiírás minden szakaszát, s garantálná, hogy a jóváhagyott beruházások átláthatók és számonkérhetőek legyenek. Ugyancsak kezdetleges a projekt-előkészítés irányítása, és nem kap kellő hangsúlyt a társfinanszírozásra való felkészülés. Feltűnő, hogy a testület által felsorolt hiányosságok nem újak: évek óta makacsul visszatérnek a PHARE-, ISPA- vagy SAPARD-támogatások esetében elhangzott bírálatok.