Az államháztartási alrendszerek mintegy harmada gazdálkodott a 2002–2003-as időszakban veszteségesen vagy forráshiányosan – derült ki az Állami Számvevőszék jelentéséből. A vizsgálat szerint a hatékonyabb ellátás csak deklarált cél volt, ám mégsem járt megtakarítással, ugyanis a két év során mintegy 20-28 milliárd forint veszteség jelentkezett a gazdasági társaságoknál. A szervezetek egy részénél előfordult, hogy az átalakítás a létszámcsökkenés ellensúlyozásaként és a társasági formával járó előnyösebb áfaelszámolási lehetőségek miatt történt. A felmérések szerint a költségvetési intézmények több mint harmada előzetes elemzés nélkül alapított szervezetet.
