A direktíva főként a bányákból származó hulladékok, szennyező anyagok hosszú távú tárolására vonatkozik, célja a vizek és a talaj szennyezésének megakadályozása, és egyaránt érvényes a külszíni és a föld alatti fejtésre. A meddőhányók kezelése és az ipari szennyvizek elvezetése kiemelt figyelmet kap. A jövőben csak akkor adnak ki bányaengedélyt, ha az – ugyancsak „harmonizálandó” – felügyeleti hatóságok meggyőződtek a biztonsági követelmények betartásáról, továbbá garancia van arra, hogy a bánya működtetése befejeztével megnyugtató módon gondoskodnak a környezet utóéletéről, amihez részletes menetrendet kell készíteni. A felügyeletnek ki kell terjednie arra is, hogy a bánya csődbe jutása vagy tulajdonosváltása esetén is kellő anyagi alap álljon rendelkezésre az esetleges kártérítésre: a „szennyező fizet” elvnek kell érvényesülnie.