Nem egyszerű a Fészekrakó program keretében lakást vagy házat építők, illetve felújítók élete. A programban részt vevő hitelt nyújtó bankok az elszámoláskor csak olyan kereskedők és szolgáltatók által kibocsátott számlát fogadnak el automatikusan, amelyek önkéntesen regisztráltak az adóhivatalnál, hogy felkerülhessenek a Fészekrakó programban elismert cégek listájára. Az APEH adatbázisában több mint 18 ezer regisztrált számlakibocsátó szerepel, de építés, illetve felújítás során ennél jóval több cégtől vásárolhatunk. Ha a fészekrakó olyan kereskedőtől vásárol, aki nem szerepel az adatbázisban, elszámolás előtt kénytelen elmenni az adóhivatalba és igazolást kérni arról, hogy az illető létező adóalany. Amennyiben a hitelfelvevő húsz ilyen cégtől kapott számlát, annyi igazolást kell beszereznie. Sokszor az országos hálózattal rendelkező, nagy forgalmú boltok sem találhatók a listán, ami feleslegesen terheli az adóhivatalt, mert megrendelőnként külön-külön adogat ki igazolásokat és megkeseríti a fészekrakók életét is.
A 2005 februárjában indult Fészekrakó program keretében eddig több mint 15 ezren éltek az állami kezességvállalás lehetőségével és húszezren kaptak félszocpolt használt lakás vásárlásához.
