Az Európai Unió transznacionális programok keretében igyekszik megteremteni annak a lehetőségét, hogy gazdasági, földrajzi vagy társadalmi szempontból egy területi egységként értelmezhető, de több országból álló területek közösen keressenek megoldásokat a térséget érintő problémákra. A mostani program előzményének tekinthető a 2000-2006 között futó Interreg III Közösségi Kezdeményezés, amely már kiemelt feladatként fogalmazta meg a határon átnyúló transznacionális és interregionális projektek támogatását. Az ilyen jellegű kezdeményezések a tapasztalatok szerint leginkább kutatási, tervezési, szakmai együttműködési jellegűek, beruházási vagy komolyabb beszerzési elemet nem tartalmaznak.
Regionális alapon az Európai Unió területét 13 makrotérségre osztották fel, Magyarország a közép-európai-adriai-dunai-délkelet-európai térség (Central Adriatic Danubian South-Eastern European Space, CADSES) tagja. A CADSES-program hatékonyságának növelése érdekében az Európai Bizottság a 2007-2013-as időszakra ezt a makrotérséget két programtérre különíti: a közép-európaira (CES) és délkelet-európaira (SEES). Hazánk mindkét programtérben teljes területével részt vesz. A programra - hangzott el a Délkelet-európai Transznacionális Együttműködési Program nemzetközi konferenciáján - 207 millió euró áll rendelkezésre. A program költségvetését az Európai Regionális Fejlesztési Alap biztosítja a részt vevő tagállamok allokációjának megfelelően. A tervezett költségvetés szerint a 2013-ig terjedő időszakban Magyarországon 21,3 millió euró áll rendelkezésre. A SEES a költségvetési időszakban a technológiai és az innovációs hálózatok kiépítésére, a közlekedési infrastruktúrára és annak hatékony működtetésére kíván koncentrálni, míg a környezetvédelem területén az integrált vízgazdálkodás fejlesztése szerepel a legfontosabb prioritások között.
