Megalakulása után egy évvel jelentős, javarészt a várakozásoknak megfelelő átalakuláson esett át a kormány. A változások egyik érdekessége, hogy Gyurcsány Ferenc személyében menedzser típusú vezető került be a miniszterek közé. A Medgyessy-kormány megalakulása óta általában bürokraták, politikai delegáltak vagy kutatók álltak a tárcák élén. A leendő ifjúsági és sportminiszter neve leginkább az Altus Befektetési és Vagyonkezelő Rt.-hez kötődik: Gyurcsány tavaly szeptember 17-én emelte 100 százalékra tulajdonhányadát a 750 millió forintos tőkével rendelkező társaságban. Az Altus komoly cégcsoport felett diszponál, a teljesség igénye nélkül megemlíthető a 33 millió forint tőkéjű Aldo és a 45 milliós Fitteline Ingatlanbefektető és Hasznosító Kft., amelyekben 91,2, illetve 89 százalékos az Altus tulajdonhányada. Érdekeltségébe tartozik a 12,17 milliós tőkével rendelkező Magyaróvári Timföld és Műkorund Rt. is, ám a legnagyobb befektetése kétségtelenül a 241 milliós Perfekt Gazdasági Tanácsadó, Oktató és Kiadó Rt., amelynek 100 százalékos tulajdonjogát múlt év június 3-án szerezte meg Gyurcsány cége. Az eddigi miniszterelnöki tanácsadó neve feltűnik a kalandos életű Mogürt történetében is.
Magának az Altusnak a története is érdekes: a társaságban a korábbi években felügyelőbizottsági tag volt Kiss Elemér ex-kancelláriaminiszter és Merényi Miklós, a Figyelő volt és az MTV híradójának jelenlegi főszerkesztője.
Távozik miniszteri posztjáról Jánosi György, az ifjúsági és sporttárca, Görgey Gábor, a kulturális, valamint Kóródi Mária, a környezetvédelmi tárca vezetője. Helyükre Gyurcsány Ferenc, Hiller István és Persányi Miklós (a budapesti állatkert főigazgatója) lép, s tárca nélküli miniszteri kinevezésre vár Lévai Katalin, az esélyegyenlőtlenségek elleni intézkedésekre kiterjedő feladatkörrel. Medgyessy Péter a váltást a kormány munkájának dinamizálásával, valamint a jóléti rendszerváltás megvalósításával indokolta. A turisztikai államtitkárság a jövőben a Miniszterelnöki Hivatalból a gazdasági tárca alá, a Területfejlesztési Hivatal és a Nemzeti Fejlesztési Tervvel foglalkozó államtitkárság az uniós ügyekért felelős tárca nélküli miniszter alá kerül. A Baja Ferenc vezette hivatal, valamint a romaügyek Lévai Katalin alá kerülnek. Több, Baja által felügyelt területet az informatikai tárca vesz át.
Az átalakítás Medgyessy Péter kormányon belüli pozíciójának megerősödését jelenti, hiszen a kinevezettek szakmai tapasztalata nem kérdéses, ugyanakkor politikai hátterüket leginkább a miniszterelnöknek köszönhetik - fejtette ki lapunknak Lakner Zoltán politológus. Hiller kinevezését Lakner azzal magyarázza, hogy a szocialisták számára ésszerűtlen lépés lett volna egyik legkarizmatikusabb politikusukat államtitkári pozícióban tartani. A környezetvédelmi tárca élére egy valódi, a szakmai szervezetekkel szót érteni képes szakember kerül, aki egyáltalán nem rendelkezik politikai tapasztalattal, ezért ezen a ponton is erősödhet a kormányfő befolyása. Az, hogy az esélyegyenlőségi minisztert csak most nevezték ki, bizonyos értelemben tekinthető a kormány kritikájának is, ugyanakkor a továbbiakban a kormány nagyobb hangsúlyt fektethet a különböző társadalmi rétegek beilleszkedésére - tette hozzá Lakner.
Török Gábor politológus szerint a jelenlegi átalakításban az a legszembetűnőbb, hogy a rendszerváltás után kialakult, „új MSZP” került hatalomra, és az SZDSZ pozícióveszteséget szenvedett. Megerősödött a kormányfő pozíciója, és a kormány szakmai jellegén történt jelentős változás azzal, hogy politikailag kisebb hátszéllel, de szakmailag elismert személyek kerültek a kormányba.
Stumpf István politológus véleménye szerint Medgyessy strukturális és stratégiaváltást hajtott végre a kormányban, így a későbbiekben a külpolitika helyett a belpolitikai témákra kerülhet a hangsúly. Stumpf szerint a környezetvédelmi tárcánál a rossz teljesítmény indokolta a változást, de az átalakítási hullám már korábban - a Miniszterelnöki Hivatal szerkezetváltozásával - megkezdődött. Stumpf meglepetésnek tartja Gyurcsány Ferenc kinevezését, ez szerinte azt jelenti, hogy a szocialista párt rájött: csak e terület kiemelt kezelésével tudja generációs lemaradását behozni. Az esélyegyenlőségi tárca nélküli miniszteri poszt létrehozásában Stumpf az SZDSZ egyik elmaradt választási ígéretének kormányszintre emelését látja.
