A NAV központi hivatal lesz, amelyben megszűnnek a regionális igazgatóságok, a rendszerben a megyei hivatalok után a másodfok a központi irányításhoz kerül. A hivatal a Nemzetgazdasági Minisztérium alá tartozik majd, irányításáért pedig a tárca adóügyi államtitkára felel. Tállai András korábban már beszélt arról, hogy négy helyettes államtitkárral közösen irányíthatják majd a szervezetet.
A Világgazdaság értesülése szerint a helyettes államtitkárok az egyes szakmai területeket felügyelhetik majd, vagyis az üzemeltetési területek vezetői csak a harmadik szintre kerülhetnek a hierarchiában.
