A kohéziós alapon belül elképzelhető, hogy a forrást nem lehet átirányítani, így ebben az esetben elképzelhető, hogy elvész a pénz. Magyarország azonban olyan rosszul áll infrastrukturálisan, hogy elképzelhetetlen a koheziós alapból finanszírozott beruházások kútba esése, hiszen sok olyan feladat van, ahová nem jut pénz.
A kohéziós alapból alapvetően két feladatot, a közlekedés és a környezetvédelem fejlesztését lehet megvalósítani. Ezeken belül egyenként át lehet csoportosítani a forrásokat, közöttük azonban nem. A strukturális alapban az adott időszakon belül (azaz a tárgyév plusz a következő két év során) a források máshol is felhasználhatóak, át lehet őket csoportosítani, ezért több projekttel is készen kell állni.
